A Unidade de Bioimagem funciona como estrutura de apoio e de acompanhamento à investigação feita com Microscopia Ótica no iMM. Para além da gestão e manutenção de sistemas de microscopia de última geração que incluem microscópios multi-fotão, confocais de varrimento laser, confocais spinning disk, sistemas de fluorescência com iluminação lightsheet e widefield, acompanhamos os investigadores de uma forma personalizada para ensinar, formar e dar assistência em microscopia e análise e processamento de imagem.
Disponibilizamos a cientistas e visitantes do iMM um elevado grau de conhecimento científico e uma vasta experiência na utilização de microscopia ótica em investigação. Oferecemos apoio técnico no planeamento de projetos que envolvam microscopia, na escolha de reagentes e equipamento, na aquisição de imagens de microscopia, na análise de resultados experimentais, no processamento de imagens adquiridas e na apresentação de resultados.
Desenvolvemos ferramentas para análise e processamento de imagens de microscopia. Em conjunto com a formação contínua a novos utilizadores, organizamos cursos e workshops de introdução às mais recentes técnicas de microscopia.
Mais Informação:
Bioimaging Wiki (em inglês)
Sistemas
Os sistemas da Bioimagem estão disponíveis 7 dias por semana e 24h por dia no sistema de reservas online para investigadores que tenham recebido formação. A formação é obrigatória para utilização independente de sistemas, mesmo para utilizadores que tenham experiência prévia em microscopia.
Microscópios Confocais de Aquisição Rápida
- 3i Marianas SDC - microscópio invertido confocal spinning disk com platina motorizada, piezo e EM-CCD
- Zeiss Cell Observer SD - microscópio invertido confocal spinning disk com platina motorizada, piezo, Definite Focus e EM-CCD
Microscópios Confocais
- Zeiss LSM 980 - microscópio invertido confocal com detetor Airyscan 2, Definite Focus, platina motorizada e incubadora de grandes dimensões
- Zeiss LSM 880 - microscópio invertido confocal com detetor Airyscan, Definite Focus, platina motorizada e incubadora de grandes dimensões
- Zeiss LSM 710 - microscópio invertido confocal com incubadora de grandes dimensões
Microscópio Multi-fotão
- Leica SP8 MP - microscópio multi-fotão com laser dual pulsado
Microscópio Lightsheet
Zeiss Lightsheet Z.1 - microscópio lightsheet preparado para aquisição de imagens de amostras aquosas ou transparentizadas (clearing)
Microscópios de Fluorescência Widefield
- Zeiss Celldiscoverer 7 – microscópio invertido widefield integrado, totalmente motorizado, ideal para aquisição automática de células e organismos vivos em placas de poços e caixas Petri, equipado com Definite Focus, incubação e preparado para aquisição guiada
- Zeiss Cell Observer - microscópio invertido widefield motorizado equipado com Definite Focus, platina motorizada e incubadora de grandes dimensões
- Nikon Eclipse Ti - microscópio invertido widefield motorizado equipado com platina motorizada e incubadora de pequenas dimensões
- Zeiss Axiovert 200M - microscópio invertido widefield motorizado equipado com platina motorizada
Lupa de Fluorescência
Microscópio Brightfield
Outros Sistemas
- IVIS Lumina - sistema de aquisição de imagem bioluminescente / fluorescente
Workstations
Preços
O uso dos sistemas de microscopia é cobrado de acordo com as reservas de utilização. A marcação online de reservas é obrigatória para cada sessão de utilização, podendo ser cancelada até à hora de início da sessão. Sessões marcadas que não sejam usadas serão cobradas por inteiro.
Como aceder ao serviço
Os sistemas da Unidade de Bioimagem estão disponíveis para investigadores do iMM e utilizadores externos.
Todos os utilizadores devem estar registados no Agendo, o nosso sistema de reservas online. Se não estiver registado ainda, por favor siga as instruções de registo (em inglês) para iMMers ou para utilizadores externos.
Após o registo, por favor entre em contacto com a Unidade de Bioimagem (imm-bioimaging@medicina.ulisboa.pt) para uma primeira reunião onde será determinado qual o microscópio mais adequado para as necessidades e será discutida a estratégia experimental.
Dependendo da frequência de utilização e das necessidades de aquisição, daremos formação para utilização independente de um microscópio ou assistência na aquisição de imagem. Apenas utilizadores que tenham recebido formação num sistema poderão marcar sessões independentes de utilização.
Prestamos assistência também na análise e processamento de imagem e na escrita de materiais e métodos em artigos científicos com dados de microscopia.
Por favor consulta a nossa Política de utilização (em inglês).
Software
Ferramentas de análise e processamento de imagem criadas pela Unidade de Bioimagem:
- STaQTool - Spot Tracking and Quantification Tool - Rastreamento e quantificação de objetos sub-resolvidos (diffraction-limited spots) em sequências temporais 2D ou 3D; quantificação de intensidade total de fluorescência por ajuste Gaussiano; deteção de eventos de ganho e perda de fluorescência
- Cell Counter L*a*b* - Contagem de células com marcação específica para núcleo e citoplasma em imagens a cores (marcações imuno-histoquímicas)
- Cell Counter L*a*b* 2 - Contagem de 2 populações diferentes de células com marcação de tonalidades azul e castanha em imagens a cores (marcações imuno-histoquímicas)
- Multichannel Cell Counter CZI - Contagem de células com combinações específicas de marcadores fluorescentes - ficheiros CZI
- Multichannel Cell Counter LSM - Contagem de células com combinações específicas de marcadores fluorescentes - ficheiros LSM
- Multichannel Cell Counter RGB - Contagem de células com combinações específicas de marcadores fluorescentes - ficheiros TIF RGB
- Multichannel Cell Counter 4TIFF - Contagem de células com combinações específicas de marcadores fluorescentes - 4 ficheiros TIF
Acknowledgements
Se usou os nossos servi;os, por favor inclua uma menção à Unidade de Bioimagem na secção de Acknowledgements da publicação científica ou outra apresentação formal. Este é um dos nossos indicadores de desempenho chave, muito importante para a obtenção de financiamento. Sugerimos os seguintes exemplos:
Materials and Methods: “Microscopy experiments were performed at the Bioimaging Unit of Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes.”
Acknowledgements: “We would like to thank the Bioimaging Unit of Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes for their technical support. We also acknowledge the funding PPBI-POCI-01-0145-FEDER-022122.”
Muito obrigado!