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Cromatina & Epigenética

O trabalho de investigação deste laboratório foca-se nos mecanismos que controlam a dinâmica da cromatina durante processo como a transcrição e a reparação de lesões no DNA. Os objetivos são perceber, a nível molecular, de que modo a estrutura da cromatina influencia as diferentes fases da transcrição e qual o seu papel na manutenção da integridade do genoma através da sinalização e reparação de lesões no DNA.

Para isso, usamos uma abordagem experimental multidisciplinar que combina técnicas de biologia molecular e celular, bioquímica, microscopia avançada e bioinformática. Dado que alterações nestes mecanismos são observadas em diferentes doenças, como o cancro, o nosso lab tem um interesse particular em investigar qual a contribuição destes processos para a transformação maligna das células e para a progressão do cancro.

Equipa de Investigação

Ana Duarte
Trainee
aiduarte@medicina.ulisboa.pt

Ana Rita Grosso
Visiting Researcher
agrosso@medicina.ulisboa.pt

Anne-Valerie Gendrel
Visiting Researcher
anne.gendrel@medicina.ulisboa.pt

Cristiana Morgado
Lab Technician
cristianamorgado@medicina.ulisboa.pt

Ines Faleiro
PhD Student
ines.faleiro@medicina.ulisboa.pt

João Sabino
PhD Student
joaosabino@medicina.ulisboa.pt

Madalena Almeida
Lab Technician
madalena.almeida@medicina.ulisboa.pt

Maria João Silva
Postdoctoral Researcher
mariajoao.silva@medicina.ulisboa.pt

Naike Salvador Moreno
Postdoctoral Researcher
naike.moreno@medicina.ulisboa.pt

Robert Martin
Senior Postdoctoral Researcher
robertmartin@medicina.ulisboa.pt

Eduardo Gameiro
MSc Student
egameiro@medicina.ulisboa.pt

Áreas de Investigação

  • Dinâmica da cromatina durante a transcrição e reparação de lesões no DNA
  • Mecanismos epigenéticos de manutenção da integridade do genoma e do transcriptoma
  • Mecanismos de detecção e reparação de lesões de DNA
  • Epigenómica do cancro

Projetos de Investigação em Curso

2018/2021 "O papel determinante que lesões no DNA desempenham na transcrição e o seu impacto na diferenciação celular e em cancro". Fundação para a Ciência e a Tecnologia. Coordenador: Sérgio de Almeida

2016/2019 "Novel tumorigenic mechanisms of aberrant epigenetic regulation in clear cell renal cell carcinoma". Fundação para a Ciência e a Tecnologia. Coordenador: Sérgio de Almeida

Prémios

  • 2015 Prémio da Sociedade Portuguesa de Genética Humana
  • 2013 Eleito laboratório associado da EpiGeneSys Network
  • 2011 Prémio Pfizer de Investigação Básica
  • 2006 Prémio LabMed Ciência
  • 2005 Prémio Pulido Valente Ciência (Menção Honrosa)

Publicações Selecionadas

For our complete publications list click here

  • Vítor AC, Sridhara SC, Sabino JC, Afonso AI, Grosso AR, Martin RM, de Almeida SF. "Single-molecule imaging of transcription at damaged chromatin" Science Advances. 2019 Jan 9;5(1):eaau1249. doi:10.1126/sciadv.aau1249.
  • Bonnet A, Grosso AR, Elkaoutari A, Coleno E, Presle A, Sridhara SC, Janbon G, Géli V, de Almeida SF, Palancade B "Introns Protect Eukaryotic Genomes from Transcription-Associated Genetic Instability" Molecular Cell 2017 Aug 17;67(4):608-621.e6 doi:10.1016/j.molcel.2017.07.002
  • Sridhara SC, Carvalho S, Grosso AR, Gallego-Paez LM, Carmo-Fonseca M, de Almeida SF "Transcription dynamics prevent RNA-mediated genomic instability through SRPK2-dependent DDX23 phosphorylation" Cell Reports. 2017 Jan 10. doi: 10.1016/j.celrep.2016.12.050
  • Grosso AR, Leite AP, Carvalho S, Matos MR, Martins FB, Vítor AC, Desterro JM, Carmo-Fonseca M, de Almeida SF “Pervasive transcription read-through promotes aberrant expression of oncogenes and RNA chimeras in renal carcinoma” eLife, 2015 Nov 17;4. pii: e09214. doi: 10.7554/eLife.09214
  • Carvalho S, Vitor A, Sridhara SC, Martins FB, Raposo AC, Desterro JM, Ferreira J, de Almeida SF*. “SETD2 is required for DNA double-strand break repair and activation of the p53-mediated checkpoint” eLife, 2014 May 6. 10.7554/eLife.02482
  • Carvalho S, Raposo AC, Martins FB, Grosso AR, Sridhara SC, Rino J, Carmo-Fonseca M, de Almeida SF. “Histone methyltransferase SETD2 coordinates FACT recruitment with nucleosome dynamics during transcription” Nucleic Acids Research, 2013 Mar 1;41(5):2881-93. doi: 10.1093/nar/gks1472.
group leader :
Sérgio de Almeida