Sérgio de Almeida Lab

Cromatina & Epigenética

O trabalho de investigação deste laboratório foca-se nos mecanismos que controlam a dinâmica da cromatina durante processo como a transcrição e a reparação de lesões no DNA. Os objetivos são perceber, a nível molecular, de que modo a estrutura da cromatina influencia as diferentes fases da transcrição e qual o seu papel na manutenção da integridade do genoma através da sinalização e reparação de lesões no DNA.

Para isso, usamos uma abordagem experimental multidisciplinar que combina técnicas de biologia molecular e celular, bioquímica, microscopia avançada e bioinformática. Dado que alterações nestes mecanismos são observadas em diferentes doenças, como o cancro, o nosso lab tem um interesse particular em investigar qual a contribuição destes processos para a transformação maligna das células e para a progressão do cancro.

Equipa de Investigação

Áreas de Investigação

• Dinâmica da cromatina durante a transcrição e reparação de lesões no DNA
• Mecanismos epigenéticos de manutenção da integridade do genoma e do transcriptoma
• Mecanismos de detecção e reparação de lesões de DNA
• Epigenómica do cancro

Projetos de Investigação em Curso

2018/2021 O papel determinante que lesões no DNA desempenham na transcrição e o seu impacto na diferenciação celular e em cancro. Coordenação: Sérgio de Almeida. Agência Financiadora: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

2018/2021 Papel fisiológico de inativação seletiva de núcleos em células multinucleadas. Coordenação: Robert Martin. Agência Financiadora: Fundação para a Ciência e a Tecnologia.

Prémios

2015 Prémio da Sociedade Portuguesa de Genética Humana

2013 Eleito laboratório associado da EpiGeneSys Network

2011 Prémio Pfizer de Investigação Básica

2006 Prémio LabMed Ciência

2005 Prémio Pulido Valente Ciência (Menção Honrosa)

Publicações Selecionadas

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• Martin RM, de Almeida MR, Gameiro E, de Almeida SF. “Live-cell imaging unveils distinct R-loop populations with heterogeneous dynamics” Nucleic Acids Research, 2023 Oct 11:gkad812. doi:10.1093/nar/gkad812.
• Sabino JC, de Almeida MR, Abreu PL, Ferreira AM, Domingues MM, Santos NC, Azzalin CM, Grosso AR, de Almeida SF. “Epigenetic reprogramming by TET enzymes impacts co-transcriptional R-loops” eLife, 2022 Feb 22;11:e69476. doi: 10.7554/eLife.69476.
• Gomes ER, de Almeida SF. “TREX1-dependent DNA damage links nuclear rupture to tumor cell invasion” Developmental Cell, 2021 Nov 22;56(22):3040-3041. doi: 10.1016/j.devcel.2021.11.003.
• Vítor AC, Sridhara SC, Sabino JC, Afonso AI, Grosso AR, Martin RM, de Almeida SF. "Single-molecule imaging of transcription at damaged chromatin" Science Advances. 2019 Jan 9;5(1):eaau1249. doi:10.1126/sciadv.aau1249.
• Bonnet A, Grosso AR, Elkaoutari A, Coleno E, Presle A, Sridhara SC, Janbon G, Géli V, de Almeida SF, Palancade B "Introns Protect Eukaryotic Genomes from Transcription-Associated Genetic Instability" Molecular Cell 2017 Aug 17;67(4):608-621.e6 doi:10.1016/j.molcel.2017.07.002
• Sridhara SC, Carvalho S, Grosso AR, Gallego-Paez LM, Carmo-Fonseca M, de Almeida SF "Transcription dynamics prevent RNA-mediated genomic instability through SRPK2-dependent DDX23 phosphorylation" Cell Reports. 2017 Jan 10. doi: 10.1016/j.celrep.2016.12.050
• Grosso AR, Leite AP, Carvalho S, Matos MR, Martins FB, Vítor AC, Desterro JM, Carmo-Fonseca M, de Almeida SF “Pervasive transcription read-through promotes aberrant expression of oncogenes and RNA chimeras in renal carcinoma” eLife, 2015 Nov 17;4. pii: e09214. doi: 10.7554/eLife.09214
• Carvalho S, Vitor A, Sridhara SC, Martins FB, Raposo AC, Desterro JM, Ferreira J, de Almeida SF. “SETD2 is required for DNA double-strand break repair and activation of the p53-mediated checkpoint” eLife, 2014 May 6. 10.7554/eLife.02482

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